2016-07-01

Was ist Bioinformatik – FAQ Version Lukas

Welche Inhalte werden im Bioinformatik Studium vermittelt

  • Mathematische Grundkenntnisse
  • Informatik (fast die gleichen Fächer wie reine Informatiker)
  • Biologische und chemische Grundlagen (Nebenfachvorlesung)
  • Grundlegende molekularbiologische Kenntnisse, ist vorallem dazu gedacht, um den Inhalt von Papern richtig einzuordnen und Fachbegriffe kennenzulernen, die auch in Programmieraufgaben vorkommen können (DNA, RNA, Makromoleküle u.v.m)
  • Datenbanksysteme -> Big Data
  • Umgang mit verschiedenen Programmiersprachen (Java, Perl, R, HTML, (no)SQL…)
  • Umgang mit Linux
  • Erarbeiten von wissenschaftlichen Vorträgen aus ausgewählten Papern zu einem bestimmten Thema
  • Ohne Teamarbeit geht gar nichts!

Was sind die Voraussetzungen für ein erfolgreiches und glückliches Bioinformatik Studium (z.B. Affinität für Naturwissenschaften, etc.)

  • Durchhaltevermögen
  • Teamfähigkeit
  • Abstraktes Denken von Vorteil
  • Englisch Kenntnisse
  • Auch mal abschalten können, wenns stressig wird
  • Nicht zwingend aber von Vorteil: Programmierkenntnisse in Java, sowie Biologie in der Oberstufe, Chemie kann auch hilfreich sein. Man schaffts aber auch ohne alles gehabt zu haben, wenn man genug Interesse zeigt! (Gibt viel Support von höheren Semester und dem Lehrstuhl)

Wer sollte lieber die Finger vom Bioinformatik Studium lassen?

  • Jemand der kein Bock hat sich auch mal länger an eine Aufgabe zu setzen und zu grübeln
  • Wenn man nicht offen für neue Denkweisen ist.
  • Wer denkt Bioinformatik ist einfacher als Informatik oder denkt Bioinformatik hat was damit zu tun irgendwelche Tiere „zu programmieren“ oder ähnliches (hat auch wenig mit Bionik zu tun!)

Was überwiegt im Studium und warum: Theorie oder Praxis? (Liest man nur oder macht man viele praktische Übungen im Labor, etc.)

  • Sehr ausgewogen, alles was man theoretisch lernt und wichtig ist kommt auch mindestens einmal in einem Übungsblatt dran.
  • In regelmäßigen Abständen: Programmierpraktika wo man sein ganzes Wissen anwenden muss. (bis in den Master hoch). Hinzu kommen Tutorien als praktische Begleitung zu manchen Vorlesungen.
  • Gibt auch ein molekularbiologisches Laborpraktikum

Sind Praktika üblich: Falls ja, wo?

  • Ja, alle an der Uni

 

Die meiste Zeit im Bioinformatik Studium verbringst du mit…

 

…dem Vergleichen von DNA- und Proteinsequenzen

…erlernen der Prinzipien von Algorithmen(/Tools), um diese im richtigen Kontext anzuwenden

…implementieren (schreiben) von bereits bekannten Algorithmen, aber auch eigene

 

Welche drei Tipps würdest du Erstis geben und warum?

  • Kommt zu unseren Ersti-Tagen, da gibt es alle wichtigen Infos und Kennung für die beiden Unis (LMU/TUM) und man lernt die Leute kennen
  • Unternehmt vor allem im ersten Semester mit euren Kommilitonen was.
  • Don’t panic, jeder Anfang ist schwer und ihr bekommt von allen Seiten Support

Welche Karrierechancen hat man nach einem Bioinformatik Studium? (Was kann man werden? In Welchen Bereichen? Wie viel Gehalt bekommt man im jeweiligen Job? Etc.)

  • Uns wird immer gesagt, dass wir gebraucht werden und bekommen „sofort“ einen Job immer mehr Daten durch medizinische/biologische Versuche , aber zu wenig Leute). Hab jetzt noch nicht gehört, dass jemand mit Abschluss jetzt arbeitslos ist (Zumal man auch in die Informatik einsteigen kann).
  • Bereiche:
    1. Industrie: Pharmaunternehmen usw. -> Forschung, Entwicklung, Managment
    2. Akademische Karriere: Forschung, Entwicklung, Lehre
    3. Was komplett anderes: Bankwesen (Datenbankumgang, große Datenmengen), eigentlich alles was mit Big Data und Machine Learning zu tun hat (Google, Facebook … ) (sofern man die richtigen Kurse gewählt hat)
  • Verdienst: In der Industrie höher als an der Uni (mit steigendem Abschluss sowieso)

Ist eine Promotion in Bioinformatik üblich? Lohnt es sich? Falls ja: warum/warum nicht? Promovieren viele?

  • Denke Promotion bringt nur was, wenn man Leiter einer Forschungsgruppe oder an die Uni will um zu forschen.
  • Kann auch glücklich mit Bachelor und Master werden, als Mitarbeiter in Forschungsgruppen etc.

Was sind ähnliche Studiengänge?

  • Biochemie, Statistik, Biomathematik, Informatik

Was sind klassische Schwerpunkte?

  • Hängt davon ab was man machen will, hier mal eine Auswahl:
    1. Algorithmic/Strucural/Network Bioinformatics, Machine Learning and Data Mining, immer aktueller: Expressionsanalysen (Daten aus next-generation-sequencing Experimenten), aber auch die von dir

Welche drei Vorurteile gibt es über das Bioinformatik Studium bzw. über den Bioinformatik Studierenden? (Die Vorurteile können entweder wahr oder falsch sein)

  • „Da muss man doch mega schlau sein“ (halbwahr)
  • Kellerkinder (absolut falsch) , Ausnahmen bestätigen aber auch hier die Regel
  • Wir können alles (falsch)

Wer sind berühmte Bioinformatiker?

  • Stephen Altschul (BLAST Algorithmus, eins der meist zitiertesten Paper, riesen Impact auf die Forschung)
  • Sonst fällt mir da spontan keiner ein und wird denk ich auch jeder anders sehen

Was sind bekannte Formeln/Sätze/whatever, die JEDER Bioinformatiker kennt/wissen muss?

  • BLAST, FASTA (beides Sequenz-Alignment-Alogrithmen)
  • Smith-Watermann
  • Boyer-Moore –Algorithmus
  • Projekte: Human Genome Project , ENCODE I & II