2016-07-01

Was ist Bioinformatik – FAQ Version David

Welche Inhalte werden im Bioinformatik Studium vermittelt?

  • Mathematische Grundkenntnisse
  • Programmieren und technische Grundlagen (muss man sich aber zu einem gewissen Teil selbst erarbeiten)
  • Informatik (da zählen für mich v.A. Algorithmen, Datenstrukturen und alles Theoretische mit rein. Eben Alles das, was ein Fachinformatiker nicht kann)
  • Molekularbiologische Grundlagen (und auch etwas „normale“ Biologie… Aber wirklich nicht viel)
  • Bioinformatische Konzepte wie Suche in Strings/Texten, Alignments von Sequenzen/Strings/Texten
  • Lesen und Verstehen von papern
  • Präsentation wissenschaftlicher Themen
  • Gestalten von Programmier-Projekten
  • Der Umgang mit Big Data
  • Umgang mit Linux

Was sind die Voraussetzungen für ein erfolgreiches und glückliches Bioinformatik Studium (z.B. Affinität für Naturwissenschaften, etc.)

  • Interesse am Lösen von schwierigen Problemen und damit verbunden etwas Durchhaltevermögen (gilt für Info aber eigentlich allgemein)
  • Englischkenntnisse (Die Literatur ist fast nur Englisch)
  • Spaß an Teamarbeit

Wer sollte lieber die Finger vom Bioinformatik Studium lassen?

  • Wer eine totale Abscheu vor Mathematik hat (Damit mein ich nicht, dass man gut in Mathe gewesen sein muss… Aber man sollte offen für neue Arten von Mathematik sein)
  • Wer denkt Bioinformatik, wäre einfacher als Informatik. (Dann lieber Bio und vielleicht paar einführende Vorlesungen in Bioinformatik)
  • Wer lernen will, wie genau Handware funktioniert (Da ist dann Info doch besser)

Was überwiegt im Studium und warum: Theorie oder Praxis? (Liest man nur oder macht man viele praktische Übungen im Labor, etc.)

  • Ist an sich ausgeglichen. Theorie und Praxis gehen oft ineinander über. Reine Auswendiglern-Vorlesungen gibt es kaum

Sind Praktika üblich: Falls ja, wo?

  • Programmieren bzw Informatik und Data Science (mehrere Praktika)
  • Ein biochemisches/molekularbiologisches Praktikum

Die meiste Zeit verbringt man mit…

  • …implementieren von Algorithmen
  • …lösen von Fragestellungen im größeren Kontext (z.B. Programmierprojekte)
  • …mathematischen Beweisen
  • …herauszufinden, welches Tool mal für welche Aufgabe braucht und wie man es exakt verwendet

Welche drei Tipps würdest du Erstis geben und warum?

  • Sich davor schon mal etwas mit Programmierung befassen, wenn man das in der Schule nicht hatte. (Als Sprache würde ich Python oder Java empfehlen)
  • Ruhe bewahren am Anfang. Bioinformatik ist interdisziplinär. Deswegen wirkt alles etwas viel und es dauert etwas bis man den Überblick hat.
  • Traue dich Fragen zu stellen, wenn etwas unklar ist.

Welche Karrierechancen hat man nach einem Bioinformatik Studium? (Was kann man werden? In Welchen Bereichen? Wie viel Gehalt bekommt man im jeweiligen Job? Etc.)

  • Forschung, freie Wirtschaft (Pharamafirmen, Softwarefirmen etc)
  • Es gibt wenig Bioinformatiker, dafür sind sie aber doch sehr gefragt. Der Bedarf an Bioinformatikern sollte durch sinkenden Kosten von Sequenzierungstechnologie höher werden. (Mehr Daten -> Nicht genug Leute zum auswerten)
  • Ansonsten sind die Karrierechancen vergleichbar mit Informatik. Im Grunde genommen kann man fast alles machen, was ein Informariker auch macht plus man hat schon mal mit Big Data gearbeitet.

Ist eine Promotion in Bioinformatik üblich? Lohnt es sich? Falls ja: warum/warum nicht? Promovieren viele?

  • Promovieren sollte man, wenn man in die Forschung will. Ansonsten ist das nicht notwendig.

Was sind ähnliche Studiengänge?

  • Ich würde nicht sagen, dass Bioinfo Biologie sehr ähnlich ist… Eher Informatik, Statistik, Theoretische Biologie (ist recht exotisch und wahrscheinlich eh größtenteils in die Bioinfo eingegangen), Biochemie

Was sind klassische Schwerpunkte?

  • Sequenzvergleiche, Systembiology, Proteinvorhersagen (Struktur, Funktion, Interaktion, etc). Ist aber alles eine Frage der Spezialisierung in höheren Semestern.

Welche drei Vorurteile gibt es über das Bioinformatik Studium bzw. über den Bioinformatik Studierenden? (Die Vorurteile können entweder wahr oder falsch sein)

  • Bioinformatiker sind alles Nerds (Finde es heraus ;))
  • Bioinformatik ist halb Biologie und Informatik (Eher Informatik mit einem Teilgebiet der Biologie als Anwendungsfach)
  • Ein Bioinformatiker kann später mal alles machen (In gewisserweise sind Bioinformatiker schon eierlegende Wollmilchsäue, gibt aber auch Sachen, die der 08/15-Informatiker sicher besser kann)

Wer sind berühmte Bioinformatiker?

  • Stephen Altschul (hat den BLAST Algorithmus erfunden)
  • Ansonsten ist das wohl sehr umstritten…
  • Projekte, die jeder Bioinformatik kennen sollte wären dagen HUGO und seine Nachfolgeprojekte (v.A. ENCODE)

Was sind bekannte Formeln/Sätze/whatever, die JEDER Bioinformatiker kennt/wissen muss?

  • Boyer Moore Algorithmus
  • Needleman-Wunsch Algorithmus
  • FASTA/BLAST (beides zumindest vom Konzept her)